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快三大发2023-01-31 16:05

提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

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(新春走基层)广州白云山花景争奇斗艳 助老广“花”式过年******

  中新网广州1月18日电 (记者 程景伟)新春佳节来临,广州白云山各式花展争奇斗艳、美不胜收,处处张灯结彩、喜气洋洋,弥漫着兔年春节的浓浓年味。郁金香、梅花、兰花等各式花景、游园活动,助力老广(广州人的俗称)“花”式过年。

  记者1月18日在广州白云山看到,在“听见花开七彩云台”郁金香主题花展中,缤纷郁金香花海与园林艺术、岭南文化创新融合。6组大型花艺作品,10万株郁金香及10多万株各类时花装点满园春色。据介绍,“巨型粉”“黄绣球”“卢浮宫”三大郁金香新优品种首次亮相。

白云山的郁金香绽放 广州市林业和园林局 供图白云山的郁金香绽放 广州市林业和园林局 供图

  中国特级花境师刘坤良创作的“你好,春天”迎春主题花境,结合精心设计的“园丁兔”和“花艺兔”ip兔兔形象亮相郁金香主题花展,为市民送来了农历癸卯兔年的新春祝福。

  “听见花开云山兰韵”兰花主题花展展出了蝴蝶兰、兜兰、石斛兰等40余个品种近6000株兰花,打造出青山绿水中的兰花仙境。多位书画爱好者1月18日受邀在广州白云山九龙泉兰花展现场泼墨献作,为市民免费挥春送“福”。

  “听见花开云山闹春”系列活动则将于大年初一(1月22日)启动。白云山鸣春谷结合玉兔纳福元素,在可憩草坪布置一对高达8米的充气萌兔,相伴草坪露营节。白云山南门广场摆设“万象更新福兔迎春”春节花境,打造白云山新年标志打卡点。

广州白云山云台花园 广州市林业和园林局 供图广州白云山云台花园 广州市林业和园林局 供图

  无醒狮,不春节。大年初一,广州白云山南门广场和山顶广场将上演“醒狮贺岁闹新春”活动。

  广州白云山桃花文化节系列活动也将大年初一开幕。目前,在占地5万平方米的白云山梅花谷,果梅、梅州宫粉、红梅等多个品种近千株梅花已怒放枝头,沁心的梅香扑面而来。预计春节期间,白云山桃花涧也将上演百桃争艳,届时还会举办非遗手作DIY、岭南押花、汉服秀等各类活动。(完)

民众着古装在白云山桃树下“打卡” 广州市林业和园林局 供图民众着古装在白云山桃树下“打卡” 广州市林业和园林局 供图

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